Na safra 2015/2016, cerca de 18% da produção colhida pelos associados da UNICOTTON, foi destinada à exportação direta, mercado fundamental à consolidação da cotonicultura nacional. Outro tanto foi também exportado indiretamente, através de comerciais exportadoras especialmente relacionadas a trocas com fornecedores de fertilizantes e defensivos.
Além do aspecto qualidade, em conformidade com a Norma NBR/ISO 9001:2008, que é oferecido aos compradores, os associados têm à sua disposição um completo sistema de acompanhamento dos carregamentos e uma estrutura de logística de embarque nos portos de Santos e Paranaguá, utilizando armazéns especializados na estufagem dos contêineres e encaminhamento aos terminais portuários. A estrutura assegura a correta manipulação, isenção de contaminações e a manutenção dos padrões originais do produto.